Eine neue Operation zur Baumverifizierung
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Eine neue Operation zur Baumverifizierung

Jun 19, 2023

Wenn Sierra Gold Nurseries eine Ladung neuer Bäume liefert, möchte das Unternehmen sicher sein, dass Sorte und Wurzelstock mit dem Etikett übereinstimmen. Das gilt auch für jedes Kinderzimmer.

Jüngste Investitionen in DNA-Screening-Technologie und Aktualisierungen der genetischen Verifizierungsverfahren der University of California machen es Baumschulen wie Sierra Gold leichter, dieses Versprechen einzulösen.

„Nur so können wir arbeiten“, sagte Reid Robinson, Chief Operating Officer bei Sierra Gold. „Verwechslungen sind schrecklich für unsere Kunden, und sie sind schrecklich für uns.“

Wie viele Baumschulen begann Sierra Gold aus Yuba City, Kalifornien, mit der Verwendung von Polymerase-Kettenreaktions- oder PCR-Genscreening-Geräten, um von Züchtern erhaltene Pflanzen zu überprüfen und die Aufzeichnungen im eigenen Gewebekulturlabor und in den Knospenplantagen zu überprüfen.

Das Unternehmen kaufte 2017 sein herkömmliches PCR-Gerät, das Gelelektrophorese einsetzt, nachdem es von einem vertrauenswürdigen Labor eine nichtkommerzielle Kirschsorte mit der fälschlichen Bezeichnung „Chelan“ erhalten hatte, und verkaufte es unwissentlich. Im Jahr 2020 kaufte das Unternehmen ein Echtzeit-PCR-Gerät. Die Echtzeittechnologie, die einst nur gut ausgestatteten Forschungslaboren vorbehalten war, führt 96 Tests genauer in der gleichen Zeit durch wie die Vorgängerversion 16.

„Man erhält viel mehr Daten und viel zuverlässigere Daten“, sagte Micah Stevens, Forschungslaborleiter bei Sierra Gold.

Mittlerweile hat sich das System außerhalb der Kindergartenmauern verändert.

In diesem Jahr begann Foundation Plant Services an der University of California, Davis, von Kunden wie Züchtern, Baumschulen, anderen Universitäten und manchmal auch von Züchtern, die Material ins Labor bringen, zu verlangen, dass sie auch eine Probe zuvor überprüften Gewebes einreichen – einen „Gutschein“. ” – für DNA-Vergleiche, sagte Maher Al Rwahnih, Direktor der Stiftung. Anschließend vermehren die Techniker die Pflanze, züchten sie und vergleichen sie mit dem Gutschein. Wenn es übereinstimmt, werden sie die Bäume für mindestens zwei Jahre weiter züchten, um sie auf Viren zu testen, und dann wird die DNA erneut untersucht.

Bisher testete die Stiftung erst am Ende des Prozesses, teilweise nachdem die Kunden, mit denen sie zusammenarbeitet, bereits vorläufige Freigaben vorgenommen hatten.

Im Jahr 2019 entdeckte die Stiftung bei einer Back-End-DNA-Probenahme einen Fehler und enthüllte, dass es sich bei einigen Gisela 5-Kirschunterlagen tatsächlich um Gisela 6 handelte, eine weniger verkleinernde Option, nachdem das Material vorläufig an den Kunden zurückgegeben worden war. Bis dahin hatte es kommerzielle Anpflanzungen erreicht. Hätte die Stiftung das neue Protokoll verwendet, wäre der Fehler früher entdeckt worden, sagte Al Rwahnih.

Solche Fehler seien ungewöhnlich, sagte Al Rwahnih, aber sie könnten passieren.

Mit der Einführung neuer Sorten und der steigenden Nachfrage nach Prüfäpfeln, Birnen und Steinobst ist das Thema noch dringlicher geworden.

„Wir müssen alle zusammenarbeiten, um Fehler zu vermeiden“, sagte Al Rwahnih.

Kunden wenden sich hauptsächlich für Virentests an die Stiftung, erhalten aber im Paket auch eine typgetreue Verifizierung. Beides ist Teil seines Mandats im Rahmen des Registrierungs- und Zertifizierungsprogramms für Laubobst- und Nussbäume des kalifornischen Landwirtschaftsministeriums. Für den Service für Obstbäume und Weinreben berechnet das Labor 355 US-Dollar pro Probe.

Das ist etwas anderes als das Clean Plant Center Northwest, das sich in den Einrichtungen der Washington State University in Prosser befindet und nur den Auftrag hat, auf Krankheiten zu untersuchen. Tatsächlich verbietet der Vertrag des Prosser-Labors mit dem National Clean Plant Network des US-Landwirtschaftsministeriums ausdrücklich die anderen Tests: „Das Netzwerk erkennt die Bedeutung der Aufrechterhaltung und Überprüfung der klonalen Pflanzenidentität, einschließlich der Typtreue; DNA-Fingerprinting und Arbeiten zur Typtreue werden jedoch möglicherweise nicht durch diese Finanzierung unterstützt.“

In der Vergangenheit habe das Prosser-Zentrum staatliche Mittel zur Genotypisierung von Weinreben erhalten und die kalifornische FPS genutzt, um diese Aufgabe zu erfüllen, sagte Scott Harper, Direktor des Zentrums. Das Labor hat auch Unternehmen, die Genotypisierungsdienste anfordern, dabei geholfen, ein privates Labor zu finden.

Die FPS-Änderungen und die Technologieinvestitionen privater Baumschulen seien in der modernen Baumobstindustrie „äußerst notwendig“, sagte Gennaro Fazio, Unterlagenzüchter des US-Landwirtschaftsministeriums im Labor der Plant Genetic Resources Unit in Genf, New York. Tatsächlich testet sein Labor das gesamte versendete Material, in der Regel Gewebekulturen, anhand einer historischen Datenbank und bittet das empfangende Unternehmen oder die empfangende Behörde, es zu testen, sobald es eintrifft und nachdem es weitergegeben wurde.

Sogar seine Einheit hat den seltenen Fehler gemacht. Vor vier oder fünf Jahren versuchte das New Yorker Labor, einen Geneva 210-Wurzelstock zu liefern, der wirklich etwas Besonderes war. Aber Al Rwahnih testete es am Frontend – obwohl das damals nicht seine Anforderung war – und erkannte den Fehler, bevor er für Virentests propagiert wurde.

„Das System hat funktioniert“, sagte Fazio. „Ich muss ihnen Anerkennung zollen, sehr viel Anerkennung.“

Zurück in Zentralkalifornien sind Robinson und Sierra Gold Fans des neuen Verfahrens von Al Rwahnih, und das nicht nur, weil es ihren Ruf schädigt, sagte Robinson. Die Mentalität „Vertrauen, aber überprüfen“ breitet sich mittlerweile in der gesamten Branche aus und wird gleichermaßen von FPS, Baumschulen und Züchtern übernommen, die versuchen, neue Sorten auf den Markt zu bringen.

„(Typtreue) liegt in der Verantwortung jedes Einzelnen“, sagte er.

– von Ross Courtney

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